Aufgaben Kap.2

PDB-Koordinaten zum Visualisieren von 3D Molekülstrukturen

Zum Herunterladen von Koordinaten im ProteinDatenbank-(PDB)-Dateiformat: SHIFT Taste drücken und mit dem Mauszeiger auf die entsprechende Verbindung klicken.

Auf dem eigenen Computer sollte eine Molekül-Visualisierungssoftware installiert sein. Empfohlen wird das Programm PyMOL (siehe Startseite unten). PyMOL kann für Ausbildungszwecke kostenfrei benutzt werden.

Und so geht's:

Unter www.pymol.org/educational als Student registrieren
Programm installieren
PDB-Dateien (*.pdb) mit dem Programm verbinden oder PyMOL öffnen und im Menu -> Open -> File laden.
Das Molekül erscheint im PyMOL Viewer (grosses Fenster) und kann dort mit der Maus rotiert, verschoben oder vergrössert werden.
Eine kurze Einführung zur Nutzung von PyMOL kann hier abgerufen werden.

Kapitel 1

Kapitel 2

1,2-Dimethylcyclohexan

Steroid